Действительно Compact может помочь. Был случай, когда БД выросла до 56 Гб, а после сжатия стала весить на много меньше - в логах было видно, что сжалась на 78 %. Лотусовая БД расширяется при увеличении в ней документов. Но если документы удалять, то БД сама не сжимается. Так что пробуйте...
Я запускал Compact с параметрами -i -c -d -K