NotesDocument - это документ в памяти, а метод uidoc.refresh нужен для обновления, фактически, отображения документа. Как можно визуально обновить документ в памяти?
Если нужно обновить какие-то значения полей в документе, проще, наверное, их заново присвоить.
Иногда может помочь метод ComputeWithForm