Протестировал и на виндовой, и на линуксовой машинах - всё нормально работает.
Для виндовых машин:
1. Создаём на диске (например, несистемном, D) папку (например, D:/Lotus/Archiv)
2. В лотусовом администраторе (это его коммуникатором обозвали?) на вкладке Files в Tools выбираем Folder - New Link.
3. В диалоговом окне выбираем Link to folder, имя - какое нравится, путь - D:/Lotus/Archiv
4. Жмём ОК
5. После обновления вида (F9) видим новую папку.
6. Делаем туда реплику перемещаемой базы, после чего старую базу удаляем.
Для линуксовых всё то же самое, только права на новую папку на уровне файловой системы надо дать пользователю, под которым запускается сервер Домино (обычно notes).