А, это. Конечно можно, просто установи необходимый триггер на запуск агента (см. скриншот 111)
Касательно задачи Designer:
На сервере Domino в notes.ini по-умолчанию есть параметр ServerTasksAt1=Catalog,Design
Так вот по этому параметру, каждый день, в час ночи запускается серверная задача Design, которая обновляет дизайн всех баз на сервере из шаблонов, указанных в свойствах базы (см. скриншот 222), так вот, если у тебя на базе есть агент, то после обновления дизайна агенты "уйдут", т.о. агент должен быть в шаблоне
PS: Уточнил, был не совсем прав по работе задачи Design. Агенты и элементы дизайна уйдут при Replace Design, а при запуске серверной задачи происходит операция аналогичная Refresh Design. Так что все останется.