Здравствуйте,
если правильно понял, то можно сделать следующее:
1) в файле notes.ini (находится в программной директории Лотуса, c:\lotus\notes) оставьте две строчки:
[Notes]
Directory=C:\lotus\notes\data
2) удалите names.nsf, bookmark.nsf, desktop6.ndk
3) запустите Lotus - должен запуститься Wizard начальной настройки