Спасибо за ответ!
Стоит версия WCS2.6.
1. Понадобилось у всех курсов изменить поле Номер курса.
Сначала была попытка сделать это в базе через таблицу CATALOGENTRY в полях CODE и CODE_LOWER, выставив произвольные значения.
Потом была найдена возможность решить эту задачу через саму систему Каталог курсов - Управление каталогом образцов.
Были отредактированы все образцы и система с очень большой задержкой обновила все предложения (Распределила).
Ещё, при редактировании предложения, не обновлялся один преподаватель для дисциплины, проблема была решена путем изменений в базе db2.
После этого некоторое время всё работало, но потом начались указанные в первом сообщении сбои.
Средствами Windows были дефрагментированны диски при работе системы и базы данных (возможно это повлияло неким образом).
2. В основном ошибка:
Missing resource for com.ibm.workplace.elearn.manager.manager for key FAILED TO SAVE ATTEMPT DATA
В таблицу ATTEMPT периодически вносились изменения в содержимом, т.к. средствами LWCL этого не удавалось.
В директории IBM\Workplace\AppServer, после возникновения проблем, стали создавать файлы heapdump*.txt и javacore*.txt.
При чём файлы создаются за короткий промежуток времени и забивают жёсткий диск до предела. heapdump*.txt весят в среднем по 800Мб.